Sapiens està dins d'un sistema, El sistema per comprendre, d'una organització, que té una cultura professional. Dins d'aquesta cultura, existeix el que podríem anomenar la filosofia: una manera de pensar i de fer les coses. La filosofia per aplicar Sapiens es basa en la idea que cal comprendre per actuar, i està formada per uns principis bàsics.
En el diccionari de la RAE hi ha moltes accepcions per a la paraula "principi", de les que ens interessen la que la defineix com a "base, origen, raó fonamental sobre la qual es procedeix discorrent en qualsevol matèria", i la que la defineix com "norma o idea fonamental que regeix el pensament o la conducta".
La nostra definició de principi es refereix a les nostres bases fonamentals per al plantejament de la metodologia i, sobretot, a unes normes o recomanacions per a l'aplicació de la metodologia. No ens referim als principis en el sentit de valors, des d'un punt de vista de l'ètica o de la moral, tot i que els nostres valors també estan reflectits en els principis de Sapiens.
Els principis en el seu conjunt formen una filosofia per a l'aplicació de Sapiens, i cada un d'ells és una norma a seguir però sempre amb flexibilitat. Més que normes concretes a seguir de manera inamovible, són recomanacions generals, adaptables a cada situació, sobre l'actitud i el punt de vista que creiem que és bo mantenir al llarg de la feina d'investigació, perquè ajudarà a la comprensió.
En aquests principis hi ha un equilibri entre dues vessants, que són dues cares d'una mateixa moneda. D'una banda, hi ha una voluntat expansiva, Una mentalitat oberta, una predisposició a desenvolupar la imaginació. D'altra banda, hi ha una voluntat de concreció, Amb rigor i realisme.
Alguns dels principis segueixen una línia que prioritza la llibertat, l'exploració, l'ampliació dels horitzons. En canvi, altres principis segueixen una línia de mantenir l'exploració i els nous horitzons dins de la serietat i el realisme.
Els principis per aplicar la metodologia Sapiens es poden resumir així: