El orden de aplicación de los métodos es una propuesta flexible. En función del proyecto, este orden puede cambiar, y algunos métodos será necesario trabajarlos de manera paralela.

Podemos distinguir entre dos tipos de métodos, según su función. El método léxico, semántico y conceptual, el método clasificatorio y el método comparativo se pueden considerar métodos posibilitadores, que hacen posible la aplicación del método sistémico y el método histórico, mientras que el método sistémico y el método histórico se pueden considerar métodos contextualizadores, que interpretan y dan significado a los anteriores.

Por lo tanto, en principio, el método léxico, semántico y conceptual, el método clasificatorio y el método comparativo se trabajan en primer lugar, en paralelo, y el método sistémico y el método histórico se trabajan a continuación, uno tras otro, aunque hay conexiones como por ejemplo en la parte del método léxico, semántico y conceptual que estudia el origen  y la evolución de las palabras, que conecta con el método histórico.

En realidad, todos los métodos tienen puntos de conexión con los demás, y el orden de aplicación vendrá marcado por varios factores condicionantes, especialmente la complejidad del tema y el nivel de profundidad del proyecto de investigación.

Si el tema es más complejo, o si el nivel de profundidad del proyecto de investigación tiene que ser muy grande, será preciso ir trabajando todas las posibles conexiones entre métodos, y por lo tanto ir trabajando los cinco métodos de manera paralela.